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環(huán)狀RNA芯片定制檢測(cè)服務(wù)

環(huán)狀RNA芯片定制檢測(cè)服務(wù)

產(chǎn)品型號(hào):

所屬分類:芯片定制及檢測(cè)實(shí)驗(yàn)

產(chǎn)品時(shí)間:2024-08-30

簡(jiǎn)要描述:收費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)/服務(wù)周期/提供結(jié)果:
歡迎咨詢?cè)斦?,我們?huì)根據(jù)您的方案及需求制定詳細(xì)的服務(wù)協(xié)議。
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詳細(xì)說(shuō)明:

環(huán)狀RNA芯片定制檢測(cè)服務(wù)

 

 

實(shí)驗(yàn)技術(shù)簡(jiǎn)介: 環(huán)狀RNA (ircRNA) 是區(qū)別于傳統(tǒng)線性RNA的一類新型RNA,具有閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu),大量存在于真核轉(zhuǎn)錄組中。大部分的環(huán)狀RNA是由外顯子序列構(gòu)成,在不同的物種中具有保守性,同時(shí)存在組織及不同發(fā)育階段的表達(dá)特異性。由于環(huán)狀RNA對(duì)核酸酶不敏感,所以比線性RNA更為穩(wěn)定, 這使得環(huán)狀RNA在作為新型診斷標(biāo)記物的開發(fā)應(yīng)用上具有明顯優(yōu)勢(shì)。近來(lái)研究顯示,環(huán)狀RNA在不同物種中起到miRNA海綿的作用,稱之為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA (ceRNA) , 能競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA。而與疾病關(guān)聯(lián)性miRNA的相互作用說(shuō)明環(huán)狀RNA對(duì)疾病的調(diào)控起著非常重要的作用。

 

實(shí)驗(yàn)操作流程:

1、樣品RNA抽提

2、RNA質(zhì)量檢測(cè)

①使用Nanodrop測(cè)定RNA在分光光度計(jì)260nm、280nm和230nm的吸收值,以計(jì)算濃度并評(píng)估純度。

②用甲醛電泳試劑進(jìn)行變性瓊脂糖凝膠電泳,檢測(cè)RNA純度及完整性。

③提供RNA QC報(bào)告。

3、RNase R處理

4、cDNA/aRNA樣品合成和標(biāo)記

5、標(biāo)記效率質(zhì)量檢測(cè)使用Nanodrop檢測(cè)熒光標(biāo)記效率,標(biāo)記效率合格以保證后續(xù)芯片實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可靠性。

6、芯片雜交

在標(biāo)準(zhǔn)條件下將標(biāo)記好的探針和高密度基因組芯片進(jìn)行雜交。

7、圖像采集和數(shù)據(jù)分析

使用GenePix 4000B芯月掃描儀掃描芯片的熒光強(qiáng)度,并將實(shí)驗(yàn)結(jié)果轉(zhuǎn)換成數(shù)字型數(shù)據(jù)保存,使用配套軟件對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析運(yùn)算。

8、提供實(shí)驗(yàn)報(bào)告

①Scanning Image: Cy3熒光掃描圖像;

②Scatter Plot:散點(diǎn)圖,X軸為Control信號(hào)值,Y軸為Experiment信號(hào)值, 表示信號(hào)數(shù)據(jù)總體分布趨勢(shì);

③Raw Data:探針的掃描熒光信號(hào)強(qiáng)度原始數(shù)據(jù);

④Normalized Data:經(jīng)過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)方法標(biāo)準(zhǔn)化后數(shù)值;

⑤P-value: T-test統(tǒng)計(jì)分析顯著差異表達(dá)的基因,p-value越小, 該circRNA在兩組樣本間差異表達(dá)越顯著

⑥significant Up & Down Regulated CircRNA List:顯著差異表達(dá)的circRNA列表包含F(xiàn)old Change, p-valuel以及circRNA的詳細(xì)注釋信息(相應(yīng)的線性mRNA和miRNA結(jié)合位點(diǎn))。

 

客戶提供:

1、實(shí)驗(yàn)對(duì)象為組織樣品,取適量(50-100mg) 新鮮組織樣品或正確保存的組織樣品,使用

BioPulverizer TM冰凍粉碎組織,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (Invitrogen) ,使用Mini-Bead-Beater-16勻漿后抽提RNA。

2、實(shí)驗(yàn)對(duì)象為細(xì)胞樣品,每份樣品取1x106~ 1x107細(xì)胞,加1m的RNA抽提試劑TRIzol (樣品為貼壁細(xì)胞,每10cm2培養(yǎng)皿TRIzo1使用量為1ml),裂解后抽提RNA。

交付標(biāo)準(zhǔn):

1、芯片檢測(cè)數(shù)據(jù)

2、完整的實(shí)驗(yàn)操作規(guī)程、實(shí)驗(yàn)報(bào)告(含軟件分析結(jié)果)以及實(shí)驗(yàn)材料

 

實(shí)驗(yàn)代做服務(wù):

ELISA試劑盒免費(fèi)代檢測(cè)

CCK8檢測(cè)

基因組DNA提取

 

蛋白相互作用分析

Western Blot

免疫組化

熒光定量PCR

動(dòng)物模型服務(wù)

流式細(xì)胞檢測(cè)

ROS氧化分析

激光共聚焦

DNA甲基化實(shí)驗(yàn)

細(xì)胞劃痕

鈣離子濃度檢測(cè)

掃描電鏡實(shí)驗(yàn)

microRNA測(cè)序

動(dòng)物實(shí)驗(yàn)

探針合成

ATP/ADP檢測(cè)

石蠟/冰凍切片

定點(diǎn)突變

線粒體膜電位(MMP)檢測(cè)

細(xì)胞生長(zhǎng)曲線的測(cè)定

藥理毒理動(dòng)物實(shí)驗(yàn)

 

免疫共沉淀

真核表達(dá)載體構(gòu)建

染色質(zhì)免疫沉淀CHIP

非標(biāo)定量(Label-free)實(shí)驗(yàn)



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